Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Yif1bQ9CX30 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms