Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NubplQ9CWD8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms