Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc3Q9CW03 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc3Q9CW03 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc3Q9CW03 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc3Q9CW03 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms