Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2310003L06RikQ9CV82 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2310003L06RikQ9CV82 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310003L06RikQ9CV82 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2310003L06RikQ9CV82 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2310003L06RikQ9CV82 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2310003L06RikQ9CV82 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms