Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sppl3Q9CUS9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sppl3Q9CUS9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sppl3Q9CUS9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms