Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms