Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms