Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms