Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rrbp1Q99PL5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rrbp1Q99PL5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms