Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms