Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep41Q99NF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms