Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrrtQ99MR6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms