Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms