Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lims1Q99JW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lims1Q99JW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms