Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn3Q99JH7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms