Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fyco1Q8VDC1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms