Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup35Q8R4R6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms