Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b4Q8QZY9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms