Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl1Q8CEQ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms