Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup88Q8CEC0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms