Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RybpQ8CCI5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RybpQ8CCI5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms