Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssc5dQ8BV57 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssc5dQ8BV57 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssc5dQ8BV57 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms