Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp54Q8BL06 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms