Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cracr2bQ80ZJ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms