Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed4Q80WQ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms