Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
AknaQ80VW7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AknaQ80VW7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AknaQ80VW7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AknaQ80VW7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AknaQ80VW7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AknaQ80VW7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AknaQ80VW7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AknaQ80VW7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AknaQ80VW7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms