Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap1Q80UJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms