Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms