Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf516Q7TSH3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf516Q7TSH3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms