Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY9

Ldoc1, Protein LDOC1, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldoc1Q7TPY9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldoc1Q7TPY9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldoc1Q7TPY9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms