Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms