Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prrc2bQ7TPM1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms