Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Letm2Q7TNU7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Letm2Q7TNU7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Letm2Q7TNU7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Letm2Q7TNU7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letm2Q7TNU7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letm2Q7TNU7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms