Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms