Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms