Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssh1Q76I79 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssh1Q76I79 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms