Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup188Q6ZQH8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms