Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ino80Q6ZPV2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms