Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn5Q6VZZ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn5Q6VZZ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms