Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift172Q6VH22 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift172Q6VH22 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms