Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms