Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc35e3Q6PGC7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms