Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc3bQ6NWW9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc3bQ6NWW9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms