Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltv1Q6NSQ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltv1Q6NSQ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltv1Q6NSQ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms