Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.19e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 48□□□□□ -1.139e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.139e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)7.62□□□□□ -1.199e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 57.52□□□□□ -1.219e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.249e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 26.48□□□□□ -1.379e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.048e-7■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 415.07■□□□□ 01e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 313.86□□□□□ -0.191e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 513.58□□□□□ -0.241e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 211.29□□□□□ -0.61e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 210.88□□□□□ -0.671e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 310.79□□□□□ -0.681e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.891e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 28.82□□□□□ -11e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 26.89□□□□□ -1.311e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.371e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 56.44□□□□□ -1.381e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.641e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 53.84□□□□□ -1.81e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.81e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.971e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-205ENST00000427501 680 ntTSL 22.05□□□□□ -2.081e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 21.02□□□□□ -2.251e-25■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.616e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.354e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.414e-7■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.434e-7■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.644e-7■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.056e-8■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 TPTEP1-203ENST00000415121 1067 ntTSL 1 (best)8.25□□□□□ -1.096e-8■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)7.6□□□□□ -1.196e-8■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.46e-8■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 LINC00958-201ENST00000504230 1558 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 LINC00958-207ENST00000534477 888 ntTSL 37.16□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 LINC00958-206ENST00000532541 1124 ntTSL 37.16□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 LINC00958-204ENST00000529328 580 ntTSL 35.68□□□□□ -1.51e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 LINC00958-205ENST00000531402 590 ntTSL 43.36□□□□□ -1.871e-6■■□□□ 14.1
NIPBLQ6KC79 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.133e-9■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.393e-9■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.913e-9■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 24.69□□□□□ -1.664e-7■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.664e-7■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.834e-7■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 518.75■□□□□ 0.596e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.046e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.76e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ARL15-204ENST00000505630 628 ntTSL 1 (best)10.66□□□□□ -0.76e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.86e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ARL15-203ENST00000505383 536 ntTSL 37.73□□□□□ -1.176e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.656e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.826e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.826e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ARL15-206ENST00000510591 804 ntTSL 52.82□□□□□ -1.966e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-217ENST00000542692 588 ntTSL 322.62■■□□□ 1.212e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-216ENST00000542532 641 ntTSL 222.15■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TTC3-212ENST00000463216 842 ntTSL 521.67■■□□□ 1.062e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TTC3-224ENST00000494243 861 ntTSL 521.56■■□□□ 1.042e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TTC3-223ENST00000492275 769 ntTSL 321.51■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.459e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 217.17■□□□□ 0.349e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 516.87■□□□□ 0.299e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZHX1-C8orf76-202ENST00000622816 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.68■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.099e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 215.15■□□□□ 0.029e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 09e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 414.5□□□□□ -0.099e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 JRK-201ENST00000503272 587 ntTSL 414.4□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 213.8□□□□□ -0.29e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.299e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 511.84□□□□□ -0.519e-14■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 RBM33-204ENST00000392755 552 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.32□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 DANCR-205ENST00000623036 748 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 JAK2-204ENST00000636127 2615 ntTSL 59.97□□□□□ -0.812e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF670-ZNF695-201ENST00000465049 1042 ntAPPRIS P5 TSL 59.69□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-211ENST00000539872 594 ntTSL 39.23□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.032e-6■■□□□ 14
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 43.6 ms