Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca2Q6DIC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms