Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzrn3Q69ZS0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
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