Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf2Q64705 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usf2Q64705 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms