Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6eQ64253 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6eQ64253 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms