Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20854Q62461 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20854Q62461 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms